Técnicas de corte del adn
Contenidos
Repaso de la estructura del ADN Bases Fosfato Azúcar Nucleótido antiparalelo:Un lado apunta hacia arriba el otro hacia abajo Forma: Doble hélice Bases Fosfato Azúcar Espina dorsal: Compuesto de Fosfato y Azúcar Nucleótido Bases: Adenina (A), Timina (T), Citosina (C), Guanina (G)
Ácido desoxirribonucleico repasoEl ADN es el código de la vida Se encuentra en todos los seres vivos La cantidad de ADN no determina la complejidad del organismo el orden de las bases es lo que determina los diferentes genes Los genes son grandes segmentos de ADN que se encuentran en los cromosomas y que codifican una proteína a su vez esa proteína determina un rasgo (pelo rojo) Un cromosoma es UNA molécula de ADN fuertemente enrollada
Replicación del ADN Repaso ¿Por qué tenemos que replicar nuestro ADN1. 1. La ADN helicasa (enzima) desenrolla el ADN en la horquilla de replicación 2. La ADN polimerasa (enzima) desenrolla el ADN en la horquilla de replicación 2. La ADN polimerasa (enzima) añade nuevos nucleótidos para crear nuevas cadenas de ADN 3. Los productos finales son SEMIConservativos una cadena es vieja = la cadena madre una cadena es nueva = la cadena hija
El ADN es como el libro Los tripletes son como las palabras Las bases son como las letras ADN Podemos pensar en la secuencia de ADN de un gen como en una frase formada íntegramente por palabras de tres letras. Fíjate en esta frase: Theesunwashotbuttheoldmandidnotgethishat. Separada en palabras de 3 letras tiene sentido: El sol calentaba pero el viejo no cogió su sombrero. El ADN son sólo palabras de 3 letras que pueden tener miles de palabras, todas ellas formadas por las bases A,T,C,G.
¿En qué se parece un código de ADN a una receta?
¿Qué es el ADN? El ADN (o ácido desoxirribonucleico) es una larga molécula que contiene nuestro código genético único. Como un libro de recetas, contiene las instrucciones para fabricar todas las proteínas de nuestro cuerpo.
¿Qué es la Cadena de 3 a 5?
La dirección 5′ – 3′ se refiere a la orientación de los nucleótidos de una única cadena de ADN o ARN. Los 5′ y 3′ se refieren específicamente a los átomos de carbono 5º y 3º del anillo de azúcar desoxirribosa/ribosa.
¿Cómo se lee una cadena de ADN?
Cuando observamos una secuencia de ADN, la leemos en la dirección 5′-3′. Las posiciones relativas de los genes u otros sitios a lo largo de una cadena de ADN pueden describirse como ascendentes (hacia el extremo 5′) o descendentes (hacia el extremo 3′).
Enzima de corte del adn
La mayoría de nosotros sabemos que nuestro genoma está formado por las bases de ADN A, C, G y T, y que el orden de estas bases explica las instrucciones de nuestros genes. Pero esta información sólo tiene sentido si sabemos por dónde empezar a leer y en qué dirección hacerlo.
Los cromosomas están ordenados numéricamente por su longitud: el par más largo de una célula humana es el cromosoma 1, el segundo más largo es el cromosoma 2 y así sucesivamente hasta el más pequeño, el cromosoma 22. Los cromosomas sexuales, C, G y T, están ordenados por su longitud. Los cromosomas sexuales, X e Y, están excluidos de esta nomenclatura (aunque el X es el octavo más largo y el Y el segundo más corto si se consideran todos los cromosomas).
Cada cromosoma es una molécula de ADN dividida en dos “brazos” a cada lado del centrómero. El más largo de estos brazos se denomina q y el más corto se denomina p, lo que resulta útil a la hora de referirse a variaciones específicas del cromosoma. Por ejemplo, a un paciente con una “deleción 14q” le falta un fragmento de ADN en el brazo largo de una copia del cromosoma 14. Los anillos de azúcar son anillos de azúcar que contienen cinco átomos de carbono cada uno.
Estos anillos de azúcar contienen cada uno cinco átomos de carbono que se numeran en el sentido de las agujas del reloj, del 1′ (se pronuncia uno primo) al 5′ (se pronuncia cinco primo). Cada anillo está unido a sus grupos fosfato vecinos por enlaces en 3′ y 5′.
Qué es el adn
Las enzimas de restricción, también conocidas como endonucleasas de restricción, son enzimas que cortan una molécula de ADN en un lugar determinado. Son herramientas esenciales para la tecnología del ADN recombinante. La enzima “escanea” una molécula de ADN, buscando una secuencia particular, normalmente de cuatro a seis nucleótidos. Una vez que encuentra esta secuencia de reconocimiento, se detiene y corta las hebras. Esto se conoce como digestión enzimática. En el ADN bicatenario, la secuencia de reconocimiento se encuentra en ambas cadenas, pero en direcciones opuestas. Esto permite a la enzima cortar ambas cadenas. A veces el corte es romo, otras veces es desigual con nucleótidos colgando en una de las dos cadenas. Este corte desigual se conoce como extremos pegajosos.
La mayoría de los plásmidos utilizados para la tecnología recombinante tienen secuencias de reconocimiento para varias enzimas de restricción. Esto permite al científico elegir entre varios lugares para cortar el plásmido con una enzima de restricción. A continuación, se pueden utilizar enzimas de ligación para pegar nuevas secuencias genómicas. Estos plásmidos mutados o recombinados pueden cultivarse en células bacterianas y utilizarse para diversos fines, como la adición de genes a genomas de mamíferos.
Unión del adn
y modelos autorregresivos profundos oord2016pixel ; van2016conditional , así como procedimientos de diseño generativo como la maximización de la activación (conocida popularmente como “sueño profundo”) simonyan2013deep ; yosinski2015understanding ; mordvintsev2015inceptionism y style transfer gatys2015neural .
También podemos utilizar herramientas generativas para explorar el espacio de posibles configuraciones de datos, ajustando los datos generados para que tengan propiedades específicas, o para inventar configuraciones nuevas e inéditas que vayan más allá de nuestra comprensión actual.
Además, estos nuevos métodos pueden aplicarse a una gran variedad de ámbitos. Como ejemplo, las refs. gomez2016automatic ; kadurin2017cornucopia ; guimaraes2017objective ; olivecrona2017molecular han aprovechado recientemente los modelos generativos para descubrir y diseñar moléculas que optimizan ciertas propiedades químicamente deseadas.
En este trabajo, presentamos modelos generativos profundos para secuencias de ADN. Los datos de secuencias de ADN podrían considerarse un híbrido entre los datos del lenguaje natural y los datos de visión por ordenador. Como en el lenguaje, los datos contienen secuencias discretas de caracteres (los nucleótidos A, C, G, T) con cierta estructura jerárquica (regiones de exones codificantes intercaladas con regiones de intrones no codificantes). Por otro lado, al igual que en la visión por ordenador, hay patrones que aparecen regularmente (motivos) situados sobre fondos que pueden ser irrelevantes o ruidosos. Así pues, esperamos adaptar patrones de diseño de ambos campos.